Журнал «Мехатроника, автоматизация, управление» издается регулярно с 2000 г.

До 2001 г. журнал издавался под названием «Мехатроника». Со второго полугодия 2006 г. до 2009 г. журнал выходил с ежемесячным приложением.

Основной целью создания нового журнала являлось освещение современного состояния и перспектив развития мехатроники и робототехники – приоритетных направлений развития техносферы. Журнал «Мехатроника, автоматизация, управление» до сих пор является единственным Российский журналом, освещающим современное состояние, тенденции и перспективы развития мехатроники, интегрирующей механику, электронику, автоматику и информатику с целью совершенствования технологий производства и создания техники новых поколений, включая качественно новые модули, системы, машины и комплексы машин с интеллектуальным управлением их функциональными движениями.

В настоящее время, наряду с проблемами мехатроники, в журнале рассматриваются проблемы теории и практики автоматического и автоматизированного управления техническими объектами и технологическими процессами в промышленности, энергетике и на транспорте.

Инициатором, вдохновителем и движущей силой учреждения и выпуска журнала стал директор Издательства «Новые технологии» Б.И. Антонов.

С момента основания Главными редакторами журнала были известные ученые: М.М. Аршанский, В.С. Кулешов, Н.А. Лакота и Е.Д. Теряев.

В состав первой редколлегии вошли ведущие специалисты в области мехатроники, автоматизации и управления, представляющих академическую, вузовскую и отраслевую науку. Многие члены первой редколлегии продолжают сотрудничество с журналом и на сегодняшний день.

С 2012 г. главным редактором журнала «Мехатроника, автоматизация, управление» является проф. Н.Б. Филимонов.

С 2001 г. журнал регулярно входит в «Перечень рецензируемых научных изданий, в которых должны быть опубликованы основные научные результаты диссертации на соискание ученой степени кандидата и доктора наук».

С 2015 г. каждой статье журнала присваивается индивидуальный индекс DOI (Digital Object Identifier).

Журнал индексируется и реферируется в Российских наукометрических базах данных на платформе eLIBRARY.RU: Российский индекс научного цитирования (РИНЦ) и SCIENCE INDEX, а также в международных базах данных: Inspec на платформе EBSCOhost, Russian Science Citation Index Russian Science Citation Index (RSCI) на платформе Web of Science.